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      8. 微量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)獲新突破

        發(fā)布于 2012/09/06閱讀(1946)來源 ljy標(biāo)簽 微量轉(zhuǎn)錄

        摘要

        9月4日電 今天,華大基因科技公司在國內(nèi)率先推出微量真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)服務(wù)—TruSeq微量轉(zhuǎn)錄組

        內(nèi)容

            9月4日電 今天,華大基因科技公司在國內(nèi)率先推出微量真核轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)服務(wù)—TruSeq微量轉(zhuǎn)錄組。該技術(shù)在國內(nèi)首次通過TruSeq RNA試劑盒成功實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄組的微量建庫,總RNA建庫起始量低至200ng,突破了微量或珍貴樣品進(jìn)行常規(guī)轉(zhuǎn)錄組建庫風(fēng)險(xiǎn)高、成功率低的瓶頸,實(shí)現(xiàn)了高效、穩(wěn)定的微量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。

          轉(zhuǎn)錄組即特定組織或細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所有基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的總和,是連接基因組遺傳信息與蛋白質(zhì)組生物功能的紐帶。轉(zhuǎn)錄組研究是基因功能及結(jié)構(gòu)研究的基礎(chǔ)和出發(fā)點(diǎn),目前已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等領(lǐng)域。然而,常規(guī)轉(zhuǎn)錄組建庫對(duì)樣品量的要求較高,許多達(dá)不到最低樣品量要求的樣品無法進(jìn)行常規(guī)建庫,比如來源稀少的干細(xì)胞、腫瘤等臨床樣本,彌足珍貴的考古樣本以及一些RNA提取困難、容易降解的特殊樣品。對(duì)于這些樣品量不足的樣品即使能夠建庫成功,也會(huì)對(duì)測(cè)序的質(zhì)量有所影響,且同一個(gè)體在不同生長時(shí)期及生長環(huán)境下基因表達(dá)情況有所差異,混合樣品建庫又會(huì)影響分析結(jié)果。這使得RNA樣品量不足成為制約轉(zhuǎn)錄組研究的重要瓶頸之一。

          使用TruSeq微量轉(zhuǎn)錄組,研究人員只需從樣品中提取出200ng的總RNA,便可進(jìn)行建庫、測(cè)序及后續(xù)信息分析。該技術(shù)不僅在建庫起始量上取得突破,也極大地提高了測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量。同時(shí),該技術(shù)還采用磁珠純化的方式,大幅度縮短了建庫時(shí)間,提高了實(shí)驗(yàn)效率。TruSeq RNA微量轉(zhuǎn)錄組的使用,可方便科研人員有效獲取某一物種特定微量或珍稀樣本在某一狀態(tài)下幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息,為后續(xù)的基因功能等研究奠定基礎(chǔ)。

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